RMVar:涉及RNA修饰的功能性变异的数据库介绍及使用方法

近些年来,以RNA m6A修饰为代表的RNA 修饰研究非常火热。RNA修饰参与了细胞中的多个关键的生理和病理调控过程,与人类疾病发生发展紧密相关。研究团队前期开发了数据库-m6Avar, 可以让用户挖掘影响m6A修饰的潜在变异,并与各种疾病进行关联。数据库受到了广泛关注和使用。为了让用户能够查阅更多的RNA修饰相关变异位点信息,我们团队对m6AVar进行了重大更新,目前包括9种RNA修饰类型,并且改进了数据库的可视化和注释功能。此外,用户还可以通过UCSC基因组浏览器访问RMVar,可以更加方便的与其他基因组特征进行关联分析。

 

2020年10月9日,中山大学肿瘤防治中心生物信息平台任间教授,左志向副研究员与附属第一医院谢宇斌副研究员合作,在Nucleic Acids Research (IF:11.501)发表了涉及RNA修饰的功能性变异的更新数据库--RMVar (地址见文末 )。值得一提的是,该研究团队在2018年发布了影响RNA m6A修饰的相关突变数据库M6Avar,两年引用达60余次(google scholar)。

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研究表明,RNA修饰相关变异与细胞中的许多生物过程失调密切相关,从而导致诸如癌症的严重疾病。涉及功能相关突变,尤其是癌症突变,可以显著改变RNA修饰的状态,导致RNA修饰位点的获得(gain)或丢失(loss)。

 

RMVar则是专门设计来收集此类功能性变异的RNA数据,旨在为揭示RNA修饰变异体潜在的功能提供帮助。

 

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